Els cursos, que s'impartiran a l'aula didàctica, es basen en l'experimentació i la participació activa dels alumnes
A través d'una metodologia basada en l'experimentació i la participació activa es proposen tota una sèrie d'activitats, adaptades als diferents nivells educatius, que complementen els continguts treballats pels alumnes a les escoles i instituts.
La temàtica dels cursos versa sobre la pintura rupestre, l'elaboració d'eines prehistòriques, l'escriptura ibèrica, com es vivia en l'època romana i durant la dominació àrab, o al voltant de la ciutat de les tres cultures, entre d'altres. El Museu ha editat uns quaderns didàctics amb tota l'oferta formativa per tal que escoles i instituts puguin informar-se.
L'aula didàctica es planteja com un espai essencial del Museu per a la transmissió dels continguts i l'instrument principal per captar l'interès del públic escolar cap a la història de la ciutat de Tortosa i del seu territori d'influència. El nou equipament, situat al pati dels llimoners del Museu, vol esdevenir una àrea polivalent amb sistemes de redistribució de la sala per adaptar-la a diferents tipus d'activitats, més enllà dels tallers i cursos. Té capacitat per a grups de fins a 30 persones i permet generar dos espais de treball per poder fer tallers independents.